Shinji, c'est un peu le mec qui a toujours été là mais qui n'arrivait pas à marquer les esprits. Cela tenait certainement au rôle important qu'il occupait dans l'organisation du village : chef de la Section Ruto et donc responsable de la traque et des prisonniers de Konoha, il se devait d'être autoritaire et charismatique tout en étant discret. Pourtant, c'est comme tous les autres shinobis qu'il a commencé son aventure : fils d'armuriers modestes et profond patriote, il décide de devenir ninja pour défendre son village. Rattaché aux geôles du village, il se fait très rapidement remarqué par l'Hokage auprès de qui il devient très proche et loyal, au point qu'il s'éloigne peu à peu de son clan natal.
Peu avant le massacre planifié par le pouvoir en place, il décide de tourner le dos à la tête des Uzumaki et de dénoncer leurs actions. Il devint ainsi une grande figure du village.