Le bâtiment du ministère est le fief de l'administration de Konoha. Le Hokage y dirige ses différents ministres afin de veiller au mieux sur le village. C'est généralement à cet endroit que les décisions les plus importantes sont prises. On peut notamment noter que la prêtresse n'y pénètre jamais, elle refuse ainsi la direction du village via ce gestion symbolique. Le marbre et le bois décorent l'intérieur avec finesse. De nombreuses patrouilles naviguent au sein du bâtiment afin de restituer des rapports de mission.